第Ⅰ篇 生物化学的基础
1 生命的分产逻辑
形形色色活有机体的化学统一性
代谢中能量的产生和消耗
生物信息的传递
生物化学世界的物理根源
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2 细胞
细胞的大小
用于生物化学研究的细胞和组织
原核生物的进化与结构
真核生物的进化
真核细胞的主要结构特点
细胞组分的研究
多细胞生物体的进化和细胞分化
病毒：细胞的寄生虫
小结
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问题
3 生物分子
化学组成和化学键
三维结构：构型和构象
知识窗3-l 路易斯·巴斯德和光学活性：酒后吐真言
化学反应性
大分子与其单体亚单位
前生命进化
小结
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问题
4 水
水相系统中的弱相互作用
知识窗4-1 植物的触敏反应：一个渗透压事件
水、弱酸与弱碱的电离
知识窗4-2 举两例说明水的离子积
生物体中通过缓冲系统维持pH恒定
知识窗4-3 用Henderson-Hasselbalch等式解下列问题
知识窗4-4 血液、肺以及缓冲液：碳酸氢盐缓冲体系
水作为反应物
液体环境适合生命存在
小结
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问题
第Ⅱ篇 结构和催化作用
5 氯基酸、多肽和蛋白质
氨基酸
知识窗5-1 分子光吸收：Lambert-Beer法则
多肽和蛋白质
如何处理蛋白质
蛋白质的共价结构
知识窗5-2 物种间的蛋白质同源性
知识窗5-3 质谱法研究蛋白质
小结
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问题
6 蛋白质的三维结构
蛋白质结构综述
蛋白质的二级结构
知知识窗6-l 区分左右手螺旋
蛋白质三级结构和四级结构
知识窗6-2 永久性卷发是一项生物化学工程
知识窗6-3 测定蛋白质三维结构的方法
蛋白质的变性和折叠
知识窗6-4 错误折叠引起的死亡：朊病毒疾病
小结
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问题
7 蛋白质功能
蛋白质与配体的可逆结合：氧结合蛋白
蛋白质与配体之间的互补作用：免疫系统和免疫球蛋白
化学能可以调节蛋白质相互作用：肌动蛋白、肌球蛋白、分子马达
小结
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问题
8 酶
酶的简介
酶的作用机制
酶促反应动力学是一种理解酶促反应机制的方法
知识窗8-1 米氏方程的变换：双倒数作图
知识窗8-2 抑制机制的动力学鉴定
酶促反应例证
知识窗8-3 过渡态互补的证据
调节酶
小结
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问题
9 糖与糖生物学
单糖和二糖
多糖
复合糖：蛋白聚糖、糖蛋白和糖脂
糖分析
小结
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问题
10 核苷酸和核酸
基础知识
核酸的结构
核酸化学
核苷酸的其他功能
小结
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问题
11 脂质
贮存型脂质
知识窗11-1 抹香鲸：深海的傻瓜
膜中的结构脂质
知识窗11-2 膜脂的异常积累导致人类遗传病
脂质作为信号分子、辅因子和色素
脂质的分离和分析
小结
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问题
12 生物膜与转运
生物膜的分子组成
膜的大分子构象
知识窗12-1 观察膜
溶质的跨膜运输
知识窗12-2 两类糖尿病人葡萄糖与水手转运缺陷
知识窗12-3 离子通道的缺失引起囊性纤维变性
小结
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问题
13 生物信号
信号传导的分子机制
知识窗13-1 Scatchard分析：定量受体-配体相互作用
门控离子通道
受体酶
G蛋白偶联受体和第二信使
视觉、嗅觉、味觉的信号传导
知识窗13-2 色盲：John Dalton的尸体检验
磷酸化是调节作用的机制
类固醇激素对转录的调节
蛋白激酶对细胞周期的调节
癌基因、肿瘤抑制基因和程序性细胞死亡
小结
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问题
第Ⅲ篇 生物能学和代谢
14 生物能量学原理
生物能量学和热力学
知识窗14-1 熵：被扰乱的优势
磷酰基团转移和ATP
知识窗14-2 细胞内ATP水解的自由能：代谢的真正消耗
知识窗14-3 萤火虫闪光：ATP的发光报告
生物氧化-还原反应
小结
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问题
15 糖酵解和己糖的分解代谢
糖酵解
有氧条件和无氧条件下丙酮酸的去向
知识窗15-1 在有限氧气浓度条件下的糖酵解：运动员、美溯鳄鱼、腔棘鱼
知识窗15-2 酿制啤酒
糖酵解的异生途径
糖代谢的调节
知识窗15-3 同工酶：不同蛋白质催化相同反应
葡萄糖氧化的戊糖磷酸途径
知识窗15-4 葡糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症：为什么毕达哥拉斯不吃沙拉三明治
小结
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问题
16 三羧酸循环
乙酸的产生
三羧酸循环的化学反应
知识窗16-1 合酶与合成酶；连接酶与裂解酶；激酶、磷酸酶和磷酸化酶：是的，这些名令人迷惑！
知识窗16-2 柠檬酸：一个发生不对称反应的对称分子
知识窗16-3 柠檬酸合酶、汽水和世界食品供应
三羧酸循环的调控
乙醛酸循环
小结
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问题
17 脂肪酸的氧化
脂肪的消化、动员和转运
β-氧化
知识窗17-1 胖熊在它们的冬眠中进行β氧化
知识窗17-2 辅酶B12：对于一个复杂问题的根本解决
酮体
小结
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问题
18 氨基酸的氧化和尿素的产生
氨基的代谢去向
知识窗18-l 组织损伤的检测
氮排泄和尿素循环
氨基酸降解的途径
知识窗18-2 科学侦探破获一桩谋杀疑案
小结
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问题
19 氧化磷酸化和光合磷酸化
氧化磷酸化
线粒体中的电子传递反应
知识窗19-1 可供选择的呼吸通路和发熟发臭的植物
ATP合成
氧化磷酸化的调控
光合作用：捕获光能
光合磷酸化的普遍特征
光吸收
主要的光化学事件：光驱动的电子流动
通过光合磷酸化作用的ATP合成
小结
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问题
20 糖的生物合成
糖异生
糖原、淀粉、蔗糖和其他糖类的生物合成
知识窗20-1 青霉素与β-内酰胺酶：神奇的子弹与防弹背心
光合作用中的糖合成
植物中糖代谢的调节
小结
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问题
2l 脂质的生物合成
脂肪酸和类二十烷酸的生物合成
知识窗21-1 双功能氧化酶、加氧酶和细胞色素P-450
知识窗21-2 环加氧酶同工酶及寻找最佳阿司匹林：减轻病痛的活性位点
三酰甘油的生物合成
膜磷脂的生物合成
胆固醇、类固醇及类异戊二烯的生物合成
知识窗21-3 载脂蛋白E等位基因预测Alzheimer疾病
小结
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问题
22 氨基酸、核苷酸及相关分子的生物合成
氮代谢概述
氨基酸的生物合成
由氨基酸衍生的生物分子
知识窗22-1 国王和吸血鬼的生物化学
知识窗22-2 用生物化学的“特洛伊木马”治愈非洲睡眠症
核苷酸的生物合成与降解
小结
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问题
23 哺乳动物物质代谢的协调与激素调控
组织特异的代谢作用：分工
燃料代谢的激素调节
第Ⅳ篇 信息途径
24基因和染色体
25 DNA代谢
26 RNA代谢
27 蛋白质代谢
28 基因表达的调控
29 重组DNA技术
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