分子模拟入门（第2版）

　　Preface to the Second Edition
　　Preface
　　List of Symbols
　　1 Introduction
　　Part 1 Basics
　　2 Statistical Mechanics
　　2.1 Entropy and Temperature
　　2.2 Classical Statistical Mechanics
　　2.2.1 Ergodicity
　　2.3 Questions and Exercises
　　3 Monte Carlo Simulations
　　3.1 The Monte Carlo Method
　　3.1.1 Importance Sampling
　　3.1.2 The Metropolis Method
　　3.2 A Basic Monte Carlo Algorithm
　　3.2.1 The Algorithm
　　3.2.2 Technical Details
　　3.2.3 Detailed Balance versus Balance
　　3.3 Trial Moves
　　3.3.1 Translational Moves
　　3.3.2 Orientational Moves
　　3.4 Applications
　　3.5 Questions and Exercises
　　4 Molecular Dynamics Simulations
　　4.1 Molecular Dynamics： The Idea
　　4.2 Molecular Dynamics： A Program
　　4.2.1 Initialization
　　4.2.2 The Force Calculation
　　4.2.3 Integrating the Equations of Motion
　　4.3 Equations of Motion
　　4.3.1 Other Algorithms
　　4.3.2 Higher-Order Schemes
　　4.3.3 LiouviUe Formulation of Time-Reversible Algorithms
　　4.3.4 Lyapunov Instability
　　4.3.5 One More Way to Look at the Verlet Algorithm
　　4.4 Computer Experiments
　　4.4.1 Diffusion
　　4.4.2 Order-Algorithm to Measure Correlations
　　4.5 Some Applications
　　4.6 Questions and Exercises
　　Part 2 Ensembles
　　5 Monte Carlo Simulations in Various Ensembles
　　5.1 General Approach
　　5.2 Canonical Ensemble
　　5.2.1 Monte Carlo Simulations
　　5.2.2 Justification of the Algorithm
　　5.3 Microcanonical Monte Carlo
　　5.4 Isobaric-Isothermal Ensemble
　　5.4.1 Statistical Mechanical Basis
　　5.4.2 Monte Carlo Simulations
　　5.4.3 Applications
　　5.5 Isotension-Isothermal Ensemble
　　5.6 Grand-Canonical Ensemble
　　5.6.1 Statistical Mechanical Basis
　　5.6.2 Monte Carlo Simulations
　　5.6.3 Justification of the Algorithm
　　5.6.4 Applications
　　5.7 Questions and Exercises
　　6 Molecular Dynamics in Various Ensembles
　　6.1 Molecular Dynamics at Constant Temperature
　　6.1.1 The Andersen Thermostat 4
　　6.1.2 Nos Hoover Thermostat
　　……
　　Part 3 Free Energies and Phase Equilibria
　　Part 4 Advanced Techniques
　　Part 5 Appendices

　　    Why did we write a second edition？ A minor revision of the first editionwould have been adequate to correct the （admittedly many） typographicalmistakes. However, many of the nice comments that we received from stu-dents and colleagues alike, ended with a remark of the type： "unfortunately,you dont discuss topic x".