上篇 DNA甲基化与表观遗传
第一章 DNA甲基化及其意义
第一节 DNA甲基化与CpG岛
第二节 DNA甲基化机制
一、DNA甲基化的模式
二、DNA甲基转移酶
三、RNA干扰与DNA甲基化
第三节 DNA甲基化与基因表达调控
一、DNA甲基化与X染色体失活
二、DNA甲基化与遗传印迹
三、DNA甲基化与染色质结构
四、DNA甲基化抑制基因表达机制
五、DNA去甲基化
第四节 DNA甲基化与肿瘤
一、DNA甲基化、基因突变与肿瘤
二、DNA损伤修复基因过甲基化与肿瘤
三、抑癌基因的过甲基化与肿瘤
四、低甲基化与肿瘤
五、去甲基化药物作用机制及其在肿瘤治疗中的应用
六、DNA甲基化与肿瘤发生机制新观念
第五节 DNA甲基化与组蛋白甲基化
第二章 DNA甲基化检测技术
第一节 定性甲基化检测方法
一、甲基化敏感的限制性内切酶法／核酸杂交法
二、限制性内切酶-PCR法
三、HS03-PCR-RFLP法以及HS03-PCR-SSCP法
四、基因组直接测序法
五、甲基化特异性PCR法
第二节 早期定量甲基化检测方法
一、亚硫酸氢钠基因组测序法
二、结合亚硫酸氢钠和限制性内切酶分析法
三、甲基化敏感的单核苷酸引物延伸法
四、MethyLight甲基化分析方法
第三节 全基因组总体甲基化检测方法
一、变性高效液相色谱法
二、酶区域性甲基化检测
三、基因组DNA甲基化毛细管电泳分析方法
第四节 基因组DNA甲基化高通量检测技术
一、DNA甲基化MALDI质谱检测技术
二、基于寡核苷酸微阵列技术
三、焦磷酸测序甲基化分析技术
四、基于MSP的DNA甲基化高通量检测方法
五、甲基化CpG岛回收DNA甲基化谱分析方法
第三章 环境应激与表观遗传学改变
第一节 环境重金属暴露与表观遗传学改变
一、镍
二、镉
三、砷
四、铅
五、铬
六、甲基汞
第二节 环境有机物暴露与表观遗传学改变
一、多环芳烃
二、笨
第三节 其他环境暴露与表观遗传学改变
一、空气颗粒物
二、石棉
第四章 DNA甲基化的研究进展
第一节 人类表观遗传计划
第二节 DNA甲基化研究的发展方向
参考文献
下篇 化学污染物去甲基化表观遗传毒性QDMP定量方法研究
第五章 概述
第一节 研究背景
一、表现遗传毒性是化学品安全性评价的新问题
二、DNA去甲基化相关实用评估方法有待创立
三、甲基化EGFP细胞重组为评价污染物表现遗传毒性开拓新途径
第二节 研究内容与技术路线
一、研究內容
二、技术路线
第六章 高甲基化C3质粒制备和人工重组HepG2细胞株构建
第一节 材料与方法
一、实验材料
二、实验方法
第二节 结果
一、C3质粒被ApaLI和EcoRI双酶切效果
二、C3质粒长片段与短片段的回收
三、C3质粒甲基化效果双酶切验证
四、C3质粒转染HepG2细胞株
第三节 讨论
第七章 QDMP方法基本原理验证和性能测试
第一节 材料与方法
一、实验材料
二、实验方法
第二节 结果
一、QDMP检测方法的基本原理可行性
二、5-AZA-CdR染毒与HepG2细胞EGFP表达的响应关系
三、QDMP检测方法的灵敏性和稳定性
第三节讨论
第八章 污染物去甲基化表观遗传毒性测试案例
第一节 QDMP检测方法在环境安全领域的初步应用
一、材料与方法
二、结果评价
第二节 QDMP检测方法在化学品安全领域的初步应用
一、材料与方法
二、结果评价
第三节 QDMP检测方法在食品安全领域的初步应用
一、材料与方法
二、结果评价
第四节 讨论
第九章 小结及展望
参考文献
附录
附录1 HepG2细胞介绍
附录2 EGFP-C3质粒介绍
附录3 实验中使用的EGFP-C3质粒全序列及关键酶切位点
附录4 实验中使用的C3质粒全序列与甲基化定量检测片段
附录5 BSP测序涉及的C3质粒原始序列和亚硫酸氢钠处理后的序列
附录6 实验中使用的主要工具酶
附录7 实验中使用的主要引物信息
附录8 甲基化测序结果比对方法(N-BLAST)
附录9 名词缩略语表
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