译者序
前言
参编者名单
第一部分 关键的生物
1 模式生物的基因组工程
1.1 绪论
1.2 特定模式原核生物的基因组工程
1.3 真核模式生物的基因组计划
1.4 总结
参考文献
2 环境基因组:研究未获培养微生物的新手段
2.1 绪论:为什么需要用新的方法来研究微生物的基因组
2.2 环境基因组学:方法学
2.3 首试:海洋环境基因组学
2.4 确定群体的环境基因组学:生物层和微生物层
2.5 用环境基因组学研究土壤微生物
2.6 生物技术方面
2.7 总结和展望
参考文献
3 基因组学在植物学中的应用
3.1 绪论
3.2 植物基因组
3.3 表达序列标签
3.4 基于DNA芯片的基因表达谱
3.5 蛋白质组学
3.6 代谢物组学
3.7 功能基因组学
3.8 总结
参考文献
4 人类遗传疾病
4.1 绪论
4.2 遗传对人类健康的影响
4.3 基因组和单基因缺陷
4.4 基因组学和多基因疾病
4.5 癌症的遗传基础
4.6 心血管疾病的遗传学
4.7 总结
参考文献
第二部分 基因组和蛋白质组技术
5 基因组定位和定位克隆及其在植物科学中的应用
5.1 绪论
5.2 基因组作图
5.3 定位克隆
5.4 比较作图与定位克隆
5.5 后基因组时代的遗传作图
参考文献
6 DNA测序技术
6.1 绪论
6.2 概观Sanger的双脱氧测序
6.3 荧光染料化学
6.4 DNA测序的生物化学
6.5 荧光DNA测序仪器
6.6 DNA序列分析
6.7 力求成本为1000美元的基因组DNA测序法
参考文献
7 用于生物研究的蛋白质组学和质谱
7.1 绪论
7.2 蛋白质组学研究中样品的定义
7.3 新的发展——临床蛋白质组学
7.4 质谱——基本的蛋白质组学技术
7.5 样品驱动的蛋白质组学进程
7.6 总结
参考文献
8 利用毛细管电泳技术进行蛋白质组分析
8.1 绪论
8.2 毛细管电泳技术
8.3 用于蛋白质分析的毛细管电泳
8.4 单细胞分析
8.5 二维分离
8.6 总结
参考文献
9 面向实验室的DNA芯片制作策略
9.1 绪论
9.2 数据库
9.3 高通量的DNA合成
9.4 扩增子产生
9.5 基因芯片
9.6 检测和扫描芯片
9.7 总结
参考文献
10 DNA微阵列的应用原理
10.1 绪论
10.2 定义
10.3 阵列的类型
10.4 阵列的产生
10.5 阵列的检测
10.6 数据分析
10.7 微阵列的记录
10.8 微阵列技术在肿瘤研究中的应用
10.9 总结
参考文献
11 酵母双杂交技术
11.1 绪论
11.2 经典的酵母双杂交系统
11.3 双杂交系统的变型
11.4 膜酵母双杂交系统
11.5 对双杂交结果的解释
11.6 总结
参考文献
12 结构基因组学
12.1 绪论
12.2 蛋白质晶体学与结构基因组学
12.3 NMR与结构基因组学
12.4 总结
参考文献
第三部分 生物信息学
13 DNA技术的生物信息学工具
13.1 绪论
13.2 比对方法
13.3 序列比较方法
13.4 一致法
13.5 简单序列屏蔽
13.6 罕见的序列构成
13.7 重复鉴定
13.8 序列模式的检测
13.9 限制酶酶切位点和启动子共有序列
13.10 EMBOSS的展望
参考文献
14 蛋白质组学技术中的软件工具
14.1 绪论
14.2 蛋白质鉴定
14.3 蛋白质性质预测
参考文献
15 生物信息学在药物发现和研发中的应用
15.1 绪论
15.2 数据库
15.3 药物靶标发现中的生物信息学
15.4 化合物扫描和毒理基因组学的支持
15.5 药物发展中的生物信息学
15.6 总结
参考文献
16 通过图形的基因组数据表示法:MAGPIE/Bluejay系统
16.1 绪论
16.2 MAGPIE绘图系统
16.3 分级的MAGPIE显示系统
16.4 概观图像
16.5 编码区显示
16.6 编码序列功能显示
16.7 二级基因组背景图像
16.8 Bluejay数据可视系统
16.9 Bluejay系统结构
16.10 Bluejay显示和数据探测
16.11 Bluejay实用性特征
16.12 总结与讨论
参考文献
……
17 研究基因表达的生物信息学工具
18 蛋白质相互作用数据库
19 用于代谢途径的生物信息学方法
20 系统生物学
第四部分 伦理、法律和社会问题
21 基因组研究和基因库的伦理学方面
22 商业化的生物银行及其挑战
23 (不)完美的人类——自身的创造者?生命之始的生物伦理和遗传学
第五部分 展望
24 大规模生命科学研究的前景
中文索引
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